海外 NGS解析 (Personalis)

次世代シーケンサーによる遺伝子解析受託サービス

サービス概要

Personalis社(US)による、DNA・RNA抽出、シーケンス前処理、シーケンス解析、詳細なデータ解析までの一連のヒト遺伝子解析サービスを提供いたします。 また、Personalisは独自に開発したACEテクノロジーにより、ターゲットキャプチャーのプロセスを改善しました。
カタログおよび資料・情報


Personalisの特長
特長1 市販のキットでは達成できなかった超高水準のデータ品質
特長2 がんに関連する遺伝子の網羅数が多い
特長3 基礎研究、治験、臨床研究の全てに対応


受託サービスのメニュー

がん研究にフォーカスした4つのサービスメニュー

サービスメニュー 概要
ACE Cancer Reserch Exome and Transcriptome 8,000以上のバイオメディカル遺伝子, 1,300以上のがん関連遺伝子に対応。
腫瘍サンプルと正常サンプルをペアで解析, 腫瘍サンプルに対して5000万リードのホールトランスクリプトーム解析を実施。
ACE Cancer Reserch DNA and RNA Panel がん研究用に開発されたDNAおよびRNAパネル解析。
1,300以上のがん関連遺伝子, 200以上のがん関連miRNA。
ACE Cancer Clinical Trial DNA and RNA Panel がん臨床試験目的のサービス。
がん研究用に開発されたDNAおよびRNAパネル解析。
1,300以上のがん関連遺伝子, 200以上のがん関連miRNA。
ACE ImmunoID がん細胞の遺伝子変異由来の抗原特定へ向けたサービス。
イムノモジュレータのミューテーションバーデンの評価。

Personalisの技術

従来の次世代シーケンサーによる解析手法には、各工程において正確性に関する問題が潜在しています。 Personalis社は、各工程が抱えているあらゆる問題を改善する新たな解析手法を確立し、高精度のデータを取得することに成功しました。

サンプル調整&シーケンシング

新たに確立した幅広いヒト試料(凍結組織, FFPE, FNA, 血液、唾液)からのDNA/RNA抽出法や 独自に開発したターゲットキャプチャーの方法であるACE法、最適化されたサンプル調製法を利用することで、ゲノムやエクソン中のギャップの改善と情報量を増強!

以下の問題点が改善され、従来ではカバーすることが困難だった領域のデータを取得することができました。

  • カバレージが低い、読めない領域が存在。
  • 重要なプロモーター領域、イントロンが含まれない。

Personalisが独自に、20以上のアルゴリズムを各アプリケーション(Cancer, DNA and RNA)について最適化し、アライメントやバリアント検出の誤りの問題を改善しました。

従来技術からの改善点

  • リファレンスが不正確なことによるアライメントの誤り
  • アライメントが不正確なことによるバリアント検出の誤り

バリアントアノテーション

40以上の公共・市販のデータベースを活用。正確なバリアントのアノテーションが可能
従来からの問題点であった「不正確なデータベースの利用」、「使用されるデータベース数の不足」を改善


Personalisのがんパネルと既存の他社のものとの比較
1,300以上のがん関連遺伝子および200以上のmiRNA遺伝子に対応。
腫瘍サンプルでは平均 x500カバレージのデータ量。
同一サンプルでのRNAパネル解析により、DNAパネルだけでは検出できないバリアント情報の入手が可能。

受託サービスの一連

Step 内 容 
Step 1 ご依頼内容のお打ち合わせ お客様 ⇔ 弊社
Step 2 御見積提出 弊社 ⇒ お客様
Step 3 正式のご注文 お客様 ⇔ 弊社
Step 4 契約書締結 お客様、弊社、Personalis
Step 5 サンプル発送 お客様 ⇒ Personalis
Step 6 NGS シーケンス、解析 Personalis
Step 7 データ (HDD) 発送 Personalis ⇒ 弊社 ⇒ お客様
Step 8 データ確認、納品検収 お客様

カタログおよび資料・情報
お問い合わせ

カタログ アプリケーションノート
personalis_ngs_personalis  アプリケーションノート「PI3Kシグナリングパスウェイ」
100-647-A_ACE_Cancer_Research_Services  ポスターダウンロードリンク(本国のサイトに移動します)
http://www.personalis.com/support/literature-and-downloads/
100-646-A-ACE_Extended_Cancer_Panel_for_DNA_and_RNA_R01  動画リンク(本国のサイトに移動します)http://www.personalis.com/support/videos/
100-878-B_ACE_ImmunoID_Mutational_Burden 論文リンク(本国のサイトに移動します)http://www.personalis.com/news-and-events/publications/dna-sequence/
100-884-B_ACE_ImmunoID_for_Neoantigen_Detection-1
100-326-B_Tumor_Genomic_Profiling_for_Clinical_Trials
BRH_ACE_Discovery_Research
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